Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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