Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COG6Q9Y2V7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms