Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms