Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLEC4EQ9ULY5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms