Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms