Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRXN1Q9ULB1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN1Q9ULB1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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