Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms