Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUX4Q9UBX2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms