Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COPS7AQ9UBW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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