Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DKK2Q9UBU2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms