Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC180Q9P1Z9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC180Q9P1Z9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms