Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAJC28Q9NX36 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms