Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms