Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms