Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNGB3Q9NQW8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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