Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC90BQ9GZT6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms