Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms