Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM7Q9C029 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms