Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM55Q9BYV6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms