Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms