Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf50Q9BV19 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms