Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDC1Q9BTX1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms