Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms