Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMM29Q9BSF4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms