Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHOX2BQ99453 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHOX2BQ99453 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms