Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCF12Q99081 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCF12Q99081 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms