Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms