Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC4A9Q96Q91 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC4A9Q96Q91 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms