Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMNQ96JQ2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLMNQ96JQ2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms