Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms