Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms