Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGF29Q96ES7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms