Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP13Q92995 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP13Q92995 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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