Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH3Q8TE77 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH3Q8TE77 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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