Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNPDA2Q8TDQ7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms