Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FNDC9Q8TBE3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC9Q8TBE3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms