Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEST4Q8NFU0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms