Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PIK3C3Q8NEB9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms