Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MS4A15Q8N5U1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms