Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM71E2Q8N5Q1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM71E2Q8N5Q1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms