Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVOPQ8N4V2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms