Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PREX2Q70Z35 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PREX2Q70Z35 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms