Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms