Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED9Q6R2W3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms