Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRRC8EQ6NSJ5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms