Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L3Q68CJ9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L3Q68CJ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms