Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARMC3Q5W041 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARMC3Q5W041 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms