Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHEQ5VZ18 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms