Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLX4IPQ5VYV7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLX4IPQ5VYV7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms