Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
OBSCNQ5VST9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms